הרב גדליה חיון נולד בטורקיה ולמד אצל הרב חיים אלפנדרי. משפחתו עלתה ארצה והתיישבה בירושלים. הוא יצא לטורקיה לשליחות מטעם היישוב היהודי בחברון, וגייס בהצלחה כספים רבים לטובת היישוב, וכל זאת ללא שכר.
בשנת 1737 ייסד בירושלים ישיבת מקובלים בשם "מדרש חסידים" ולאחר זמן שינה את שמהּ לישיבת "בית אל". הישיבה הפכה למרכז גבוה ללימוד תורת הסוד למקובלי ירושלים, ובתוך זמן קצר החלו להגיע אליה גם תלמידים מחוץ לארץ. בין הלומדים בישיבה היו הרב יוסף דוד אזולאי (חיד"א) והרב גרשון מקיטוב. הרב גדליה חיון חתום על תקנות שונות ועל הסכמות (המלצות) לספרים רבים. על פי בקשתו, מונה תלמידו הרב שלום שרעבי לראשות הישיבה בשנת 1750. הרב גדליה חיון נפטר בשנת 1751.